Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM42Q9BTD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms