Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINFPQ9BQA5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms