Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms