Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYD88Q99836 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms