Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms