Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms