Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX11Q96FC9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms