Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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