Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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