Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms