Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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COPS9Q8WXC6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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COPS9Q8WXC6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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