Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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C15orf40Q8WUR7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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C15orf40Q8WUR7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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C15orf40Q8WUR7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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C15orf40Q8WUR7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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C15orf40Q8WUR7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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C15orf40Q8WUR7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf40Q8WUR7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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