Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM71E2Q8N5Q1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms