Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms