Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP47Q6ZTR5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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