Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms