Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms