Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms