Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf141Q5SZD1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf141Q5SZD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms