Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHC1Q5JVL4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms