Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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