Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF11Q15544 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF11Q15544 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms