Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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