Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A6Q14031 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A6Q14031 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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