Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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