Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BNIP3Q12983 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP3Q12983 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms