Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.71□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 snR53snR53 91 nt1.71□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 YJR039WYJR039W 3366 nt1.7□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 snR47snR47 99 nt1.7□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 RAD50YNL250W 3939 nt1.69□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 VPS15YBR097W 4365 nt1.69□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 KIP1YBL063W 3336 nt1.69□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 DNF3YMR162C 4971 nt1.68□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 YLR041WYLR041W 321 nt1.68□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 GLG1YKR058W 1851 nt1.68□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 MEC1YBR136W 7107 nt1.67□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 ORC3YLL004W 1851 nt1.67□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 YAR009CYAR009C 3591 nt1.67□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 CFT1YDR301W 4074 nt1.66□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 ALY2YJL084C 3141 nt1.66□□□□□ -2.14
PUS9Q12069 YLR422WYLR422W 5799 nt1.65□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 snR14snR14 160 nt1.65□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 NUT1YGL151W 3399 nt1.65□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 MMS4YBR098W 2076 nt1.64□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 snR64snR64 101 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 RPL26BYGR034W 384 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 snR190snR190 190 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 TRM3YDL112W 4311 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 PIK1YNL267W 3201 nt1.62□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 ASE1YOR058C 2658 nt1.62□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 SMC4YLR086W 4257 nt1.62□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 PAN2YGL094C 3348 nt1.62□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 GEA2YEL022W 4380 nt1.62□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 TDA9YML081W 3756 nt1.61□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.61□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 NOP9YJL010C 2001 nt1.61□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 NUP192YJL039C 5052 nt1.61□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 AZF1YOR113W 2745 nt1.6□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 MON2YNL297C 4911 nt1.59□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 snR50snR50 90 nt1.59□□□□□ -2.15
PUS9Q12069 SEC10YLR166C 2616 nt1.59□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 WAR1YML076C 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 EMC5YIL027C 426 nt1.57□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.57□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 RAD9YDR217C 3930 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 FIG2YCR089W 4830 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 STO1YMR125W 2586 nt1.55□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 BRR2YER172C 6492 nt1.55□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 NNF2YGR089W 2811 nt1.54□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 IRA1YBR140C 9279 nt1.54□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 UBP3YER151C 2739 nt1.53□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 KCS1YDR017C 3153 nt1.53□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 CAT8YMR280C 4302 nt1.53□□□□□ -2.16
PUS9Q12069 YDL073WYDL073W 2955 nt1.52□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 KAP122YGL016W 3246 nt1.52□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 PMD1YER132C 5262 nt1.52□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 RPM2YML091C 3609 nt1.51□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 BEM3YPL115C 3387 nt1.51□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 SKI3YPR189W 4299 nt1.5□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 SXM1YDR395W 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.49□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 YKL225WYKL225W 348 nt1.48□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 MSH3YCR092C 3057 nt1.48□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 TRM732YMR259C 4263 nt1.47□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.47□□□□□ -2.17
PUS9Q12069 MYO1YHR023W 5787 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 ANS1YHR126C 480 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 PRP16YKR086W 3216 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 HKR1YDR420W 5409 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.44□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.44□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 FYV8YGR196C 2454 nt1.43□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 BST1YFL025C 3090 nt1.43□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 PET127YOR017W 2403 nt1.42□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 EST1YLR233C 2100 nt1.42□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 APL3YBL037W 3078 nt1.41□□□□□ -2.18
PUS9Q12069 LAA1YJL207C 6045 nt1.4□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 SSK2YNR031C 4740 nt1.4□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.39□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.39□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 SEC8YPR055W 3198 nt1.38□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 snR69snR69 101 nt1.37□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.37□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.37□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.37□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 CCH1YGR217W 6120 nt1.37□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YCS4YLR272C 3531 nt1.36□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 NUP188YML103C 4968 nt1.36□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 SEC3YER008C 4011 nt1.35□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 CSE1YGL238W 2883 nt1.34□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.34□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.34□□□□□ -2.19
PUS9Q12069 SWI4YER111C 3282 nt1.34□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 RPL41AYDL184C 78 nt1.33□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.33□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 snR38snR38 95 nt1.32□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 YSP1YHR155W 3687 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 CDC39YCR093W 6327 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 snR75snR75 89 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS9Q12069 EST2YLR318W 2655 nt1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms