Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms