Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms