Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms