Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF4Q08170 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms