Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4A11Q02928 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms