Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms