Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms