Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms