Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms