Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCN3P51790 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms