Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPZBP47756 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms