Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNT3P45378 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT3P45378 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms