Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms