Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms