Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTX2P32243 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTX2P32243 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTX2P32243 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTX2P32243 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
OTX2P32243 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OTX2P32243 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTX2P32243 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTX2P32243 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTX2P32243 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTX2P32243 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTX2P32243 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms