Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8A1P23610 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8A1P23610 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8A1P23610 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8A1P23610 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8A1P23610 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8A1P23610 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8A1P23610 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8A1P23610 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms