Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PVALBP20472 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms