Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD46P15529 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD46P15529 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD46P15529 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD46P15529 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD46P15529 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD46P15529 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD46P15529 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD46P15529 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD46P15529 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD46P15529 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD46P15529 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms