Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DOAP06340 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms