Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms