Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNTO95613 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNTO95613 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNTO95613 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNTO95613 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms