Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG12O94817 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG12O94817 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms