Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN5O75503 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN5O75503 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN5O75503 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN5O75503 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms